Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCE3A1L190 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYCE3A1L190 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYCE3A1L190 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCE3A1L190 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCE3A1L190 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCE3A1L190 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms