Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC23A1Q9UHI7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC23A1Q9UHI7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms