Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDPD3Q7L5L3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDPD3Q7L5L3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms