Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 POLR2M-201ENST00000299638 4199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.461e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 POLR2M-202ENST00000380557 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-207ENST00000477282 1536 ntTSL 26.3□□□□□ -1.41e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GCOM1-209ENST00000484300 955 ntTSL 25.04□□□□□ -1.61e-13■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 GPAT4-208ENST00000521184 572 ntTSL 410.55□□□□□ -0.722e-10■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 228.03■■■□□ 2.089e-20■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 320.32■□□□□ 0.849e-20■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 518.45■□□□□ 0.549e-20■■■■■ 33.4
DDX3XO00571 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-31■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.023e-31■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 FOXM1-201ENST00000342628 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-31■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.273e-31■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.984e-11■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-11■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 TCEAL8-203ENST00000451678 449 ntTSL 38.58□□□□□ -1.044e-11■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 KLHL23-206ENST00000498202 843 ntTSL 317.18■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.199e-12■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.079e-12■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.229e-12■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.373e-10■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.013e-10■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRELID2-209ENST00000515475 582 ntTSL 426.87■■□□□ 1.893e-10■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.413e-10■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.823e-10■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRELID2-203ENST00000505097 338 ntTSL 39.3□□□□□ -0.923e-10■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.243e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.133e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.983e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.473e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.31e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.273e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-204ENST00000579383 731 ntTSL 214.32□□□□□ -0.121e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 PRMT2-205ENST00000397637 2880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.443e-24■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-209ENST00000584686 541 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.461e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-201ENST00000438705 509 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.611e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.711e-13■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 MGAT1-210ENST00000506033 464 ntTSL 229.09■■■□□ 2.255e-14■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 MGAT1-217ENST00000510341 553 ntTSL 417.23■□□□□ 0.355e-14■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 MGAT1-216ENST00000508702 313 ntTSL 417.23■□□□□ 0.355e-14■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 MGAT1-218ENST00000510962 445 ntTSL 513.05□□□□□ -0.325e-14■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 MGAT1-221ENST00000513149 356 ntTSL 46.82□□□□□ -1.325e-14■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 MGAT1-215ENST00000508090 475 ntTSL 45.46□□□□□ -1.545e-14■■■■■ 33.3
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DDX3XO00571 UNC93B1-208ENST00000533424 1275 ntTSL 522.7■■□□□ 1.221e-9■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 UNC93B1-210ENST00000622364 1021 ntTSL 222.67■■□□□ 1.221e-9■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.211e-9■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 UNC93B1-206ENST00000530138 821 ntTSL 219.86■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 UNC93B1-202ENST00000524455 836 ntTSL 518.06■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 UNC93B1-205ENST00000528423 833 ntTSL 314.59□□□□□ -0.071e-9■■■■■ 33.3
DDX3XO00571 CAPN1-222ENST00000532285 568 ntTSL 423.58■■□□□ 1.373e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.963e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-211ENST00000527739 582 ntTSL 419.59■□□□□ 0.733e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.713e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-206ENST00000526966 550 ntTSL 418.63■□□□□ 0.573e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-205ENST00000526954 754 ntTSL 517.43■□□□□ 0.383e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.153e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-216ENST00000528739 341 ntTSL 514.62□□□□□ -0.073e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.113e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-215ENST00000528396 571 ntTSL 413.78□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-209ENST00000527469 584 ntTSL 313.78□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-207ENST00000527189 558 ntTSL 413.56□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-228ENST00000534373 581 ntTSL 313.56□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-217ENST00000529133 593 ntTSL 512.1□□□□□ -0.473e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 CAPN1-218ENST00000530442 577 ntTSL 211.51□□□□□ -0.573e-11■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.812e-10■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 SLC25A30-205ENST00000522438 453 ntTSL 525.32■■□□□ 1.644e-8■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 SLC25A30-203ENST00000519547 582 ntTSL 418.07■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 SLC25A30-202ENST00000463262 426 ntTSL 316.16■□□□□ 0.184e-8■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 SLC25A30-201ENST00000310862 1094 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-8■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.314e-8■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-213ENST00000589226 604 ntTSL 214.16□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-210ENST00000588147 489 ntTSL 1 (best)13.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-215ENST00000592920 583 ntTSL 513.31□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TNNT1-205ENST00000586282 327 ntTSL 55.78□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TFDP2-201ENST00000464782 640 ntTSL 422.01■■□□□ 1.112e-14■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-14■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TFDP2-216ENST00000491667 566 ntTSL 220.47■□□□□ 0.872e-14■■■■■ 33.2
DDX3XO00571 TFDP2-207ENST00000475734 578 ntTSL 520.47■□□□□ 0.872e-14■■■■■ 33.2
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