Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEURL4Q96JN8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEURL4Q96JN8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEURL4Q96JN8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms