Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOFQ13790 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APOFQ13790 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOFQ13790 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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