Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.246e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.416e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 512.47□□□□□ -0.416e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.786e-8■■■■□ 23
PABPC4Q13310 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.189e-7■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 STARD10-212ENST00000538437 747 ntTSL 222.33■■□□□ 1.179e-7■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.029e-7■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.999e-7■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.141e-8■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.036e-9■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.146e-9■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 ARAF-205ENST00000470206 646 ntTSL 59.11□□□□□ -0.956e-9■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL6-209ENST00000551041 1082 ntTSL 212.85□□□□□ -0.351e-57■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL6-203ENST00000546368 2008 ntTSL 510.22□□□□□ -0.771e-57■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.181e-57■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL6-207ENST00000550238 338 ntTSL 57.43□□□□□ -1.221e-57■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-57■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL6-210ENST00000551291 700 ntTSL 37.02□□□□□ -1.291e-57■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL6-205ENST00000549562 583 ntTSL 26.52□□□□□ -1.371e-57■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.384e-7■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-7■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 BRD4-201ENST00000263377 7169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.433e-14■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 S100A6-203ENST00000462776 479 ntTSL 216.95■□□□□ 0.33e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RPL14-208ENST00000479563 794 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.226e-21■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.522e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.162e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 DHRS2-209ENST00000557535 927 ntTSL 520.79■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.872e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 DHRS2-208ENST00000556729 5318 ntTSL 217.95■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 DHRS2-207ENST00000556701 3157 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 DHRS2-206ENST00000556550 2595 nt15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.428e-10■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-215ENST00000556587 1863 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.152e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.292e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-208ENST00000554929 947 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-216ENST00000556647 644 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-217ENST00000557154 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.452e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 SRSF5-207ENST00000554465 3044 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.952e-19■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.723e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 NFKBIB-203ENST00000509705 2200 ntTSL 220.23■□□□□ 0.833e-6■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-16■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 215.04■□□□□ -02e-20■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-20■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 38.07□□□□□ -1.122e-20■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 NDUFA3-207ENST00000420296 339 ntTSL 311.04□□□□□ -0.641e-14■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-12■■■■□ 22.9
PABPC4Q13310 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.239e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.349e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.569e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.594e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ATAD3A-201ENST00000339113 2330 ntTSL 219.08■□□□□ 0.644e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)19.8■□□□□ 0.761e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.561e-11■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-11■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.331e-10■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SPOUT1-204ENST00000467582 898 ntTSL 216.17■□□□□ 0.189e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.019e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.132e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SNU13-202ENST00000355257 1503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SELENOK-204ENST00000495461 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 MINOS1-202ENST00000462646 335 ntTSL 323.02■■□□□ 1.285e-11■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 MRPS16-204ENST00000473427 612 ntTSL 321.37■■□□□ 1.018e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 MRPS16-203ENST00000471251 658 ntTSL 28.09□□□□□ -1.118e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.376e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.066e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-222ENST00000600320 913 ntTSL 523.35■■□□□ 1.331e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-214ENST00000597396 1019 ntTSL 323.29■■□□□ 1.321e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.151e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-202ENST00000593764 870 ntTSL 322.19■■□□□ 1.141e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.061e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-203ENST00000594298 716 ntTSL 321.49■■□□□ 1.031e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-204ENST00000594862 623 ntTSL 321.41■■□□□ 1.021e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-212ENST00000596163 785 ntTSL 320.63■□□□□ 0.891e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-224ENST00000600718 1993 ntTSL 519.9■□□□□ 0.781e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 TMEM55B-203ENST00000553460 811 ntTSL 519.81■□□□□ 0.766e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-216ENST00000598201 2069 ntTSL 218.97■□□□□ 0.631e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-205ENST00000594973 2339 ntTSL 218.81■□□□□ 0.61e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 SHKBP1-208ENST00000595726 684 ntTSL 317.15■□□□□ 0.341e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 TMEM55B-207ENST00000557041 3453 ntTSL 217.09■□□□□ 0.336e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.186e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 FPGS-211ENST00000475270 560 ntTSL 215.74■□□□□ 0.113e-13■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.036e-14■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-8■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 KDM4A-201ENST00000372396 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 LARP1B-210ENST00000512292 3105 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.711e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 LARP1B-202ENST00000394288 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 LARP1B-207ENST00000507377 1593 ntTSL 210.24□□□□□ -0.771e-9■■■■□ 22.8
PABPC4Q13310 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.791e-8■■■■□ 22.8
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