Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT7

FBXL3, F-box/LRR-repeat protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL3Q9UKT7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXL3Q9UKT7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXL3Q9UKT7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms