Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.465e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.445e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.425e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.295e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-238ENST00000592412 532 ntTSL 429.25■■■□□ 2.275e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-210ENST00000586636 938 ntTSL 228.63■■■□□ 2.175e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-232ENST00000591376 830 ntTSL 328.63■■■□□ 2.175e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.165e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.165e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.15e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-243ENST00000593128 796 ntTSL 327.96■■■□□ 2.075e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-244ENST00000593283 758 ntTSL 527.25■■□□□ 1.955e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.895e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-206ENST00000585914 1052 ntTSL 526.79■■□□□ 1.885e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.665e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-241ENST00000593048 650 ntTSL 325.02■■□□□ 1.65e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-240ENST00000592815 334 ntTSL 424.97■■□□□ 1.595e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-230ENST00000591055 928 ntTSL 224.75■■□□□ 1.555e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-212ENST00000587169 3028 ntTSL 223.65■■□□□ 1.385e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 522.66■■□□□ 1.225e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 THOP1-207ENST00000587401 702 ntTSL 221.79■■□□□ 1.083e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-228ENST00000590347 3117 ntTSL 219.68■□□□□ 0.745e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-242ENST00000593093 3528 ntTSL 218.79■□□□□ 0.65e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CIRBP-236ENST00000592051 573 ntTSL 417.39■□□□□ 0.375e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 MAPRE3-204ENST00000458529 878 ntTSL 516.43■□□□□ 0.225e-11■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-212ENST00000480047 575 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.055e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.045e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 MAPRE3-202ENST00000402218 1001 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.135e-11■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.235e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-204ENST00000421088 707 ntTSL 511.57□□□□□ -0.565e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-213ENST00000483054 592 ntTSL 311.41□□□□□ -0.585e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.595e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-214ENST00000483077 750 ntTSL 38.85□□□□□ -0.995e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-210ENST00000476368 605 ntTSL 38.1□□□□□ -1.115e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-207ENST00000450646 739 ntTSL 57.33□□□□□ -1.245e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 HK1-208ENST00000464803 450 ntTSL 1 (best)3.42□□□□□ -1.865e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CD164-209ENST00000512212 590 ntTSL 221.77■■□□□ 1.081e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.081e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.431e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.091e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.391e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.422e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.842e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 SMPD4P1-201ENST00000416717 2263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.135e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)27.79■■■□□ 2.041e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.771e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 225.17■■□□□ 1.621e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 225.11■■□□□ 1.611e-6■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.184e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 224.89■■□□□ 1.574e-7■■■□□ 18.7
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-205ENST00000589361 679 ntTSL 1 (best)24.52■■□□□ 1.525e-38■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 OAZ1-208ENST00000592727 726 ntTSL 223.16■■□□□ 1.37e-38■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 NDUFC2-KCTD14-204ENST00000614236 386 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.237e-17■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.017e-17■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.482e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 FBXO17-203ENST00000596025 935 ntTSL 230.24■■■□□ 2.432e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.432e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 FBXO17-207ENST00000601394 2366 ntTSL 522.84■■□□□ 1.252e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.182e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.564e-15■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 MBD6-210ENST00000549623 544 ntTSL 432.52■■■□□ 2.84e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 MAP2K7-206ENST00000475022 1519 ntTSL 1 (best)27.27■■□□□ 1.964e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 MBD6-207ENST00000548887 568 ntTSL 421.94■■□□□ 1.14e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.171e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-206ENST00000519321 692 ntTSL 334.61■■■■□ 3.131e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.471e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-213ENST00000524288 732 ntTSL 1 (best)5.7□□□□□ -1.51e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.751e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-201ENST00000328392 572 ntTSL 53.29□□□□□ -1.881e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 33.29□□□□□ -1.881e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-205ENST00000519054 654 ntTSL 32.45□□□□□ -2.021e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.131e-8■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.565e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-208ENST00000473256 1771 ntTSL 227.84■■■□□ 2.055e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 526.72■■□□□ 1.875e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-217ENST00000568209 266 ntTSL 526.57■■□□□ 1.845e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.825e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.075e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.695e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.485e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.626e-7■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGEF18-203ENST00000594665 4616 ntTSL 222.4■■□□□ 1.183e-6■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.153e-6■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.083e-6■■■□□ 18.6
DROSHAQ9NRR4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.753e-6■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 PPP2R3B-206ENST00000477110 5802 ntTSL 1 (best)20.83■□□□□ 0.933e-6■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 NDUFA4-206ENST00000492822 566 ntTSL 59.12□□□□□ -0.954e-15■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-15■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 NDUFA4-205ENST00000486007 434 ntTSL 28.67□□□□□ -1.024e-15■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.45e-7■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 MAPK15-206ENST00000484654 2240 ntTSL 1 (best)25.69■■□□□ 1.75e-7■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.635e-7■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.255e-7■■■□□ 18.5
DROSHAQ9NRR4 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-12■■■□□ 18.5
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