Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC7Q96NW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC7Q96NW7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms