Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 MTG2-202ENST00000448254 727 ntTSL 511.85□□□□□ -0.512e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 MTG2-206ENST00000467101 2814 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.892e-9■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-9■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-9■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 SGPL1-208ENST00000620724 868 ntTSL 59.33□□□□□ -0.927e-16■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 SGPL1-207ENST00000618021 562 ntTSL 49.08□□□□□ -0.967e-16■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 PANK2-204ENST00000471830 622 ntTSL 35.7□□□□□ -1.51e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 AMBP-204ENST00000603230 1057 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.333e-13■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-274ENST00000557633 527 ntTSL 39.89□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-253ENST00000556366 772 ntTSL 57.19□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 NDRG2-278ENST00000635386 672 ntTSL 35.6□□□□□ -1.512e-6■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.771e-14■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-14■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 VWA1-204ENST00000495558 819 ntTSL 212.99□□□□□ -0.331e-14■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 PPIF-205ENST00000498681 518 ntTSL 214.45□□□□□ -0.11e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 514.91□□□□□ -0.022e-12■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-12■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-12■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 MRPS6-205ENST00000488492 909 ntTSL 55.36□□□□□ -1.552e-12■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.892e-12■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 ACADVL-209ENST00000578033 562 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-9■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 MAN2C1-208ENST00000562461 591 ntTSL 412.81□□□□□ -0.364e-9■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 SKI-203ENST00000507179 539 ntTSL 211.03□□□□□ -0.643e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 PRSS21-205ENST00000571141 484 ntTSL 216.79■□□□□ 0.282e-14■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 TF-210ENST00000482271 659 ntTSL 415.73■□□□□ 0.113e-13■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 SNRNP200-205ENST00000480835 540 ntTSL 211.94□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.252e-9■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 RBM39-219ENST00000453310 1068 ntTSL 213.06□□□□□ -0.322e-9■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 RBM39-213ENST00000433027 611 ntTSL 512.56□□□□□ -0.41e-10■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 36.48□□□□□ -1.371e-10■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 STRN4-205ENST00000593979 675 ntTSL 415.3■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.15e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.095e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 KIF12-206ENST00000639832 2564 ntTSL 214.65□□□□□ -0.065e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 KIF12-208ENST00000640553 2003 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.515e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.695e-7■■□□□ 12.5
PRPF8Q6P2Q9 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.66□□□□□ -0.76e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.066e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SRPK1-209ENST00000507909 581 ntTSL 48.14□□□□□ -1.114e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.231e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA4-206ENST00000595867 766 ntTSL 319.13■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA4-205ENST00000594195 616 ntTSL 216.34■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SPG7-211ENST00000565370 686 ntTSL 310.49□□□□□ -0.733e-15■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 KLHDC4-214ENST00000565328 582 ntTSL 411.89□□□□□ -0.514e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 58.77□□□□□ -1.013e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM86B-203ENST00000589190 1508 ntTSL 216.83■□□□□ 0.289e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM86B-202ENST00000585416 2034 nt15.36■□□□□ 0.059e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.149e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.17□□□□□ -0.629e-10■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DLG5-208ENST00000476354 1198 ntTSL 214.98□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 RAB11B-204ENST00000600719 532 ntTSL 412.1□□□□□ -0.476e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DAGLB-203ENST00000432248 558 ntTSL 417.12■□□□□ 0.331e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CPLX2-207ENST00000514150 970 ntTSL 417.02■□□□□ 0.319e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA3-203ENST00000588984 1779 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA3-206ENST00000590238 830 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CPLX2-205ENST00000509837 557 ntTSL 413.72□□□□□ -0.219e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.219e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 APBA3-205ENST00000590064 4250 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.342e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.389e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.589e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CPLX2-210ENST00000515502 469 ntTSL 49.28□□□□□ -0.929e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 AMFR-207ENST00000566334 426 ntTSL 28.43□□□□□ -1.061e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 NAPA-213ENST00000597118 553 ntTSL 47.87□□□□□ -1.154e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 NAPA-208ENST00000594288 562 ntTSL 47.57□□□□□ -1.24e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 NAPA-218ENST00000598615 379 ntTSL 36.61□□□□□ -1.354e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF414-207ENST00000599379 418 ntTSL 24.47□□□□□ -1.691e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CD55-209ENST00000488171 1389 ntTSL 316.55■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 320.93■□□□□ 0.948e-23■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LDLR-206ENST00000557958 1881 ntTSL 213.14□□□□□ -0.312e-7■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC12A7-203ENST00000510943 421 ntTSL 310.38□□□□□ -0.751e-6■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.013e-12■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.195e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 413.45□□□□□ -0.265e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERGIC1-207ENST00000520326 647 ntTSL 512.42□□□□□ -0.425e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 WDR45-223ENST00000480412 437 ntTSL 211.91□□□□□ -0.55e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DDB2-215ENST00000622090 580 ntTSL 511.35□□□□□ -0.595e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 WDR45-217ENST00000472654 605 ntTSL 311.35□□□□□ -0.595e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC6A8-206ENST00000457723 266 ntTSL 510.8□□□□□ -0.685e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 WIPI2-207ENST00000471851 2523 ntTSL 210.38□□□□□ -0.755e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DDB2-205ENST00000610805 793 ntTSL 59.99□□□□□ -0.815e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DDB2-208ENST00000614825 852 ntTSL 39.88□□□□□ -0.835e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DDB2-210ENST00000615695 897 ntTSL 28.93□□□□□ -0.985e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 ERGIC1-201ENST00000326654 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.335e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 BCL3-206ENST00000473473 445 ntTSL 25.8□□□□□ -1.485e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.655e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.75e-8■■□□□ 12.4
PRPF8Q6P2Q9 DENND1A-209ENST00000475615 360 ntTSL 34.33□□□□□ -1.725e-8■■□□□ 12.4
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 459.6 ms