Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSKUQ8WUA8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms