Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms