Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GCAP28676 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GCAP28676 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GCAP28676 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GCAP28676 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GCAP28676 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GCAP28676 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms