Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GADD45AP24522 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GADD45AP24522 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms