Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GOLGA6L3A6NEY3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms