Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms