Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NDUFA13Q9P0J0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NDUFA13Q9P0J0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms