Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NLRP1Q9C000 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NLRP1Q9C000 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms