Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCAPERQ9BY12 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SCAPERQ9BY12 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms