Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms