Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.833e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.763e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.153e-9■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CUL2-205ENST00000374754 4440 ntTSL 517.18■□□□□ 0.346e-12■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.076e-12■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.346e-12■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CUL2-202ENST00000374748 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.446e-12■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.646e-12■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.566e-12■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.576e-12■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.021e-14■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.871e-14■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.993e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PSMC5-218ENST00000584657 576 ntTSL 28.46□□□□□ -1.064e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.026e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.26e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.46e-8■■■■□ 23.6
PABPC4Q13310 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.872e-7■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.848e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 MT2A-204ENST00000563985 688 ntTSL 216.59■□□□□ 0.258e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.218e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 MT2A-203ENST00000562017 903 nt16.14■□□□□ 0.178e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 MT2A-205ENST00000567300 416 ntTSL 216.14■□□□□ 0.178e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 KIFC3-216ENST00000564136 3071 ntTSL 214.89□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.119e-7■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 NDUFV2-205ENST00000474740 264 ntTSL 24.61□□□□□ -1.672e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 METTL26-212ENST00000568773 499 ntTSL 221.3■■□□□ 15e-10■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.055e-21■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 CHCHD5-203ENST00000454841 748 ntTSL 220.16■□□□□ 0.823e-7■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 CHCHD5-204ENST00000469030 529 ntTSL 318.9■□□□□ 0.623e-7■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 CHCHD5-201ENST00000324913 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-7■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 CHCHD5-202ENST00000409719 3272 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.754e-10■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.514e-10■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-10■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.374e-10■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-10■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.154e-10■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 EDC4-204ENST00000572221 5267 ntTSL 222.86■■□□□ 1.251e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.121e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 EDC4-214ENST00000577105 580 ntTSL 319.21■□□□□ 0.671e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 EDC4-207ENST00000573992 3934 ntTSL 1 (best)12.26□□□□□ -0.451e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 AC040162.3-201ENST00000572067 3907 ntBASIC10.86□□□□□ -0.671e-9■■■■□ 23.5
PABPC4Q13310 CYBA-205ENST00000565588 221 ntTSL 213.12□□□□□ -0.318e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PSMD13-202ENST00000382671 1489 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.618e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.498e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PSMD13-204ENST00000525665 1632 ntTSL 517.73■□□□□ 0.438e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.348e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.328e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PSMD13-201ENST00000352303 1427 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.058e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PSMD13-207ENST00000527982 2200 nt13.09□□□□□ -0.318e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 RPS17-204ENST00000559776 760 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-42■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 KPNB1-212ENST00000582126 653 ntTSL 516.45■□□□□ 0.224e-66■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 FAM207A-203ENST00000458015 643 ntTSL 524.08■■□□□ 1.455e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PIN1-211ENST00000592184 517 ntTSL 229.06■■■□□ 2.242e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 GRHPR-204ENST00000480596 1893 ntTSL 220.29■□□□□ 0.845e-10■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.85e-10■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 PIN1-208ENST00000589058 536 ntTSL 317.03■□□□□ 0.322e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 GRHPR-209ENST00000494290 1593 ntTSL 516.89■□□□□ 0.295e-10■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-14■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 GRHPR-210ENST00000497693 4762 ntTSL 214.17□□□□□ -0.145e-10■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 JADE1-213ENST00000610919 5644 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.772e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 519.34■□□□□ 0.694e-8■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.524e-11■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.654e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 CCNE1-204ENST00000574121 1295 ntTSL 218.5■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.394e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.364e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 CCNE1-206ENST00000576532 1085 ntTSL 512.11□□□□□ -0.474e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.331e-12■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 FGD5-AS1-201ENST00000417835 1630 ntTSL 1 (best)26.56■■□□□ 1.846e-10■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 FGD5-AS1-203ENST00000426200 1874 ntTSL 1 (best)24.67■■□□□ 1.546e-10■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 512.31□□□□□ -0.448e-23■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.978e-7■■■■□ 23.4
PABPC4Q13310 NUBP2-209ENST00000566090 708 ntTSL 225.32■■□□□ 1.643e-6■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 NUBP2-210ENST00000566447 511 ntTSL 422.34■■□□□ 1.173e-6■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 NUBP2-204ENST00000563821 2235 nt21.28■■□□□ 13e-6■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.981e-6■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.387e-8■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.966e-22■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.916e-22■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.576e-22■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.296e-22■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-9■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-7■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 PRKAR2A-207ENST00000457914 448 ntTSL 312.07□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.865e-9■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.35e-9■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 WDTC1-205ENST00000491239 5149 ntTSL 214.91□□□□□ -0.025e-9■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 WDTC1-203ENST00000447062 3115 ntTSL 213.69□□□□□ -0.225e-9■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 HSPG2-211ENST00000486901 3586 ntTSL 213.56□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 23.3
PABPC4Q13310 NSUN4-201ENST00000307089 4344 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.838e-8■■■■□ 23.3
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