Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VAX2Q9UIW0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms