Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC39A9Q9NUM3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC39A9Q9NUM3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms