Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HES3Q5TGS1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms