Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 COPB1-212ENST00000534771 576 ntTSL 41.06□□□□□ -2.242e-11■■■■■ 33.8
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PCBP2Q15366 TAGLN-201ENST00000278968 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TAGLN-208ENST00000533863 3298 ntTSL 1 (best)12.31□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TAGLN-203ENST00000525531 1048 ntAPPRIS P1 TSL 512.13□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 33.7
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PCBP2Q15366 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.211e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 ATF5-203ENST00000596658 722 ntTSL 217.51■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 33.7
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PCBP2Q15366 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 ATF5-204ENST00000597227 828 ntTSL 315.38■□□□□ 0.051e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-209ENST00000441192 1224 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.262e-48■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-210ENST00000472912 2629 ntTSL 213.4□□□□□ -0.263e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-208ENST00000433289 1618 ntTSL 1 (best)13.39□□□□□ -0.273e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 RARA-207ENST00000475125 813 ntTSL 511.13□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-201ENST00000305762 1820 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.763e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-211ENST00000474131 512 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.992e-48■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CUX1-210ENST00000497815 947 ntTSL 211.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CUX1-216ENST00000558469 588 ntTSL 49.29□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-27■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TMEM138-202ENST00000381787 1205 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.961e-27■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TMEM138-207ENST00000539776 1635 ntTSL 25.65□□□□□ -1.511e-27■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 TMEM138-211ENST00000543833 534 ntTSL 22.95□□□□□ -1.941e-27■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.19e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.932e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-8■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.612e-19■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 COL4A5-203ENST00000470339 782 ntTSL 314.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 MKL2-212ENST00000575768 389 ntTSL 33.28□□□□□ -1.883e-12■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 33.7
PCBP2Q15366 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 38.25□□□□□ -1.094e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 47.14□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 313.39□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 515.93■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 314.3□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 58.27□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 56.07□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-10■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-10■■■■■ 33.6
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PCBP2Q15366 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.192e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 ERGIC1-211ENST00000523215 3621 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 33.6
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PCBP2Q15366 TK1-206ENST00000592126 631 ntTSL 318.72■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 TK1-202ENST00000586613 631 ntTSL 316.2■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-220ENST00000581806 576 ntTSL 415.42■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-232ENST00000585111 1051 ntTSL 214.78□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-219ENST00000581697 580 ntTSL 514.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-207ENST00000578400 575 ntTSL 513.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-218ENST00000581693 2156 ntTSL 511.45□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-203ENST00000540698 2225 ntTSL 511.27□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-233ENST00000585223 699 ntTSL 210.66□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-202ENST00000450599 2077 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-231ENST00000585060 572 ntTSL 48.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 DDX5-215ENST00000581230 3558 ntTSL 27.9□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.035e-12■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.781e-6■■■■■ 33.6
PCBP2Q15366 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.287e-7■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 213.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 HTD2-207ENST00000498618 557 ntTSL 418.56■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 RPP14-203ENST00000461797 531 ntTSL 415.5■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 HTD2-202ENST00000474660 888 ntTSL 215.5■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 33.5
PCBP2Q15366 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 33.5
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