Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 213.02□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 HGS-214ENST00000576087 548 ntTSL 415.29■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 HMBS-207ENST00000536185 441 ntTSL 315.39■□□□□ 0.057e-10■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 CYB5B-206ENST00000568237 577 ntTSL 53.93□□□□□ -1.781e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 CYB5B-207ENST00000568342 648 ntTSL 53.67□□□□□ -1.821e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 512.78□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.845e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 29.36□□□□□ -0.917e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.035e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.255e-7■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.223e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 DHX38-202ENST00000562774 500 ntTSL 418.91■□□□□ 0.621e-8■■■■■ 40.2
EFTUD2Q15029 PGS1-210ENST00000588281 1776 ntTSL 1 (best)16.94■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 46.99□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 RBM39-233ENST00000482563 1737 ntTSL 27.11□□□□□ -1.273e-17■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 RBM39-235ENST00000490354 436 ntTSL 24.46□□□□□ -1.73e-17■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 RBM39-241ENST00000496183 632 ntTSL 23.93□□□□□ -1.783e-17■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CAMTA1-213ENST00000490738 538 ntTSL 225.05■■□□□ 1.63e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 SRM-205ENST00000487300 611 ntTSL 220.99■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 SRM-202ENST00000459997 731 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CAMTA1-209ENST00000476163 863 ntTSL 218.18■□□□□ 0.53e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 TBPL1-202ENST00000367869 623 ntTSL 317.79■□□□□ 0.448e-16■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.48e-16■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.338e-16■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 TBPL1-205ENST00000457715 865 ntTSL 516.16■□□□□ 0.188e-16■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 TBPL1-204ENST00000416965 991 ntTSL 314.33□□□□□ -0.128e-16■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 PES1-209ENST00000466614 713 ntTSL 210.9□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.818e-16■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 PES1-207ENST00000433575 560 ntTSL 58.12□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.293e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 CAMTA1-202ENST00000461311 431 ntTSL 24.66□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 SNHG4-206ENST00000508735 310 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 TRAF4-215ENST00000584944 825 ntTSL 213.51□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 SH3TC1-208ENST00000504223 698 ntTSL 317.12■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 ADCY6-208ENST00000552090 861 ntTSL 514.8□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 VPS28-203ENST00000524521 564 ntTSL 1 (best)19.83■□□□□ 0.773e-11■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 VPS28-211ENST00000530790 561 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 KHSRP-205ENST00000595223 956 ntTSL 516.46■□□□□ 0.232e-10■■■■■ 40.1
EFTUD2Q15029 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.679e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.069e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.989e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.869e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 VRK2-205ENST00000432057 1870 ntTSL 1 (best)20.22■□□□□ 0.839e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.589e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.459e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.419e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 COPS6-210ENST00000496358 610 ntTSL 217.55■□□□□ 0.43e-12■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-223ENST00000513991 2172 ntTSL 217.07■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-210ENST00000551888 636 ntTSL 217.07■□□□□ 0.329e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-207ENST00000550419 919 ntTSL 316.86■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-214ENST00000508158 2121 ntTSL 216.52■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 VRK2-204ENST00000428021 553 ntTSL 415.97■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 POFUT1-205ENST00000486717 959 ntTSL 215.93■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 DUS2-208ENST00000565980 685 ntTSL 215.82■□□□□ 0.129e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 315.31■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 214.93□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.059e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-225ENST00000515521 796 ntTSL 514.21□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-212ENST00000507041 455 ntTSL 314.11□□□□□ -0.159e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 LIN37-207ENST00000591163 532 ntTSL 513.58□□□□□ -0.249e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 POFUT1-204ENST00000465791 768 ntTSL 313.52□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 512.76□□□□□ -0.379e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-213ENST00000507246 387 ntTSL 512.46□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 RGS12-207ENST00000504194 3522 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 LIN37-205ENST00000590890 591 ntTSL 210.81□□□□□ -0.689e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CDK4-213ENST00000552713 685 ntTSL 27.74□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.419e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.749e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.659e-9■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.529e-9■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.479e-9■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 LRRC45-203ENST00000581227 1145 ntTSL 519.45■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 VARS-219ENST00000461328 662 ntTSL 314.68□□□□□ -0.061e-9■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 CHMP1A-206ENST00000549139 812 ntTSL 215.04■□□□□ -04e-7■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 TRAPPC8-207ENST00000580104 5014 ntTSL 214.18□□□□□ -0.141e-10■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 TRAPPC8-211ENST00000582539 4391 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.781e-10■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 TRAPPC8-206ENST00000578886 578 ntTSL 43.04□□□□□ -1.921e-10■■■■■ 40
EFTUD2Q15029 FKBP2-205ENST00000536642 637 ntTSL 217.84■□□□□ 0.452e-12■■■■■ 39.9
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1587.5 ms