Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ODF1Q14990 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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ODF1Q14990 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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ODF1Q14990 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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ODF1Q14990 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ODF1Q14990 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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