Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ODF1Q14990 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ODF1Q14990 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ODF1Q14990 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ODF1Q14990 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ODF1Q14990 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ODF1Q14990 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ODF1Q14990 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ODF1Q14990 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ODF1Q14990 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ODF1Q14990 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ODF1Q14990 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ODF1Q14990 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ODF1Q14990 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF1Q14990 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ODF1Q14990 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ODF1Q14990 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ODF1Q14990 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ODF1Q14990 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ODF1Q14990 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ODF1Q14990 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ODF1Q14990 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ODF1Q14990 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ODF1Q14990 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF1Q14990 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ODF1Q14990 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF1Q14990 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ODF1Q14990 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF1Q14990 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ODF1Q14990 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODF1Q14990 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ODF1Q14990 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF1Q14990 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ODF1Q14990 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ODF1Q14990 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF1Q14990 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ODF1Q14990 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF1Q14990 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF1Q14990 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF1Q14990 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF1Q14990 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF1Q14990 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ODF1Q14990 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ODF1Q14990 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF1Q14990 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF1Q14990 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF1Q14990 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF1Q14990 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ODF1Q14990 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ODF1Q14990 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ODF1Q14990 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ODF1Q14990 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ODF1Q14990 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ODF1Q14990 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ODF1Q14990 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF1Q14990 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ODF1Q14990 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ODF1Q14990 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ODF1Q14990 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ODF1Q14990 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF1Q14990 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF1Q14990 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF1Q14990 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF1Q14990 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF1Q14990 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF1Q14990 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF1Q14990 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF1Q14990 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF1Q14990 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ODF1Q14990 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF1Q14990 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF1Q14990 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF1Q14990 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF1Q14990 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF1Q14990 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF1Q14990 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF1Q14990 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF1Q14990 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF1Q14990 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF1Q14990 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF1Q14990 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF1Q14990 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODF1Q14990 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ODF1Q14990 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODF1Q14990 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ODF1Q14990 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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