Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RPS28P62857 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RPS28P62857 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RPS28P62857 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RPS28P62857 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RPS28P62857 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RPS28P62857 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RPS28P62857 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RPS28P62857 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms