Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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