Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C3Q9Y5Q9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms