Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf141Q5SZD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf141Q5SZD1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf141Q5SZD1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf141Q5SZD1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf141Q5SZD1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C6orf141Q5SZD1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C6orf141Q5SZD1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms