Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ANKRD55Q3KP44 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms