Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC173Q0VFZ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC173Q0VFZ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms