Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP2O95045 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP2O95045 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UPP2O95045 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UPP2O95045 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP2O95045 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms