Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SNRPA-210ENST00000601393 969 ntTSL 315.92■□□□□ 0.145e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 NOP53-211ENST00000600266 666 ntTSL 215.67■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 215.64■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 NCAPH2-210ENST00000523045 970 ntTSL 515.22■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 315.18■□□□□ 0.023e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 03e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CANT1-206ENST00000588096 369 ntTSL 1 (best)15.01□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 BRAT1-202ENST00000421712 823 ntTSL 314.99□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-222ENST00000487647 1608 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.023e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.113e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 NOP53-203ENST00000594525 876 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 FGFR1-234ENST00000530568 467 ntTSL 39.63□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ACSS2-224ENST00000497927 580 ntTSL 49.46□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.935e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ZNHIT1-204ENST00000492315 3958 ntTSL 29.17□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 20.9
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PRPF4O43172 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 27.63□□□□□ -1.195e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 BRMS1L-203ENST00000548758 1077 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)6.22□□□□□ -1.413e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 26.09□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.633e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 DNAJC10-202ENST00000418559 2988 ntTSL 1 (best)4.32□□□□□ -1.723e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ACSS2-218ENST00000490046 455 ntTSL 44.27□□□□□ -1.733e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.753e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 MALRD1-206ENST00000492202 557 ntTSL 43.8□□□□□ -1.83e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CHD4-209ENST00000542717 204 ntTSL 33.04□□□□□ -1.923e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 ACSS2-203ENST00000461051 403 ntTSL 32.77□□□□□ -1.973e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 FGFR1-235ENST00000530701 276 ntTSL 1 (best)2.17□□□□□ -2.063e-6■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-10■■■■□ 20.9
PRPF4O43172 CAPRIN2-215ENST00000546129 501 ntTSL 419.86■□□□□ 0.777e-9■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.552e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.13■■□□□ 1.132e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.13■■□□□ 1.132e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.132e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.972e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-8■■■■□ 20.8
PRPF4O43172 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-8■■■■□ 20.8
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