Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6E4

CCDC134, Coiled-coil domain-containing protein 134, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC134Q9H6E4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC134Q9H6E4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC134Q9H6E4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms