Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX1Q16384 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SSX1Q16384 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX1Q16384 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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