Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SKIV2LQ15477 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms