Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-203ENST00000446152 1549 ntTSL 514.25□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRSS21-206ENST00000574265 860 ntTSL 314.24□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KMT2C-207ENST00000452749 479 ntTSL 513.77□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AHI1-215ENST00000531788 3655 ntTSL 213.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-206ENST00000547064 759 ntTSL 313.74□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-208ENST00000463555 852 ntTSL 513.59□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 HDGFL2-205ENST00000601353 648 ntTSL 513.45□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 213.38□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 MTA1-219ENST00000551236 461 ntTSL 313.28□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 GOLGA2P5-203ENST00000397112 2632 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 513.2□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 GOLGA2P5-204ENST00000421840 2343 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TEX22-202ENST00000548638 508 ntTSL 513.14□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 COG4-203ENST00000482252 2953 ntTSL 213.12□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 NANS-204ENST00000461452 3027 ntTSL 212.99□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-209ENST00000538995 814 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.373e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-201ENST00000338850 493 ntTSL 212.67□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CHCHD6-206ENST00000513253 690 ntTSL 312.57□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-208ENST00000495834 820 ntTSL 212.56□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-208ENST00000550577 817 ntTSL 212.46□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-208ENST00000529263 770 ntTSL 512.39□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 COG4-207ENST00000530314 3488 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 COG4-205ENST00000526700 1978 ntTSL 512.29□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-202ENST00000378615 1651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 COG4-211ENST00000564415 3000 ntTSL 512.13□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-206ENST00000525279 560 ntTSL 412.08□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-208ENST00000449395 6662 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-209ENST00000535434 1587 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-219ENST00000552817 668 ntTSL 311.65□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-217ENST00000534533 836 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-203ENST00000462761 374 ntTSL 311.61□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-205ENST00000441787 6542 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-207ENST00000493987 839 ntTSL 311.48□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-209ENST00000526424 556 ntTSL 411.15□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-212ENST00000541318 600 ntTSL 411.02□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CORO1C-218ENST00000552030 547 ntTSL 510.97□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-211ENST00000527234 593 ntTSL 510.85□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-217ENST00000531648 770 ntTSL 210.85□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CORO1C-209ENST00000547361 683 ntTSL 210.51□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRSS21-209ENST00000575739 378 ntTSL 310.45□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-205ENST00000528191 569 ntTSL 410.4□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-207ENST00000462578 609 ntTSL 39.75□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-205ENST00000522712 825 ntTSL 29.66□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-219ENST00000532840 719 ntTSL 29.57□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM5C-210ENST00000467093 446 ntTSL 39.42□□□□□ -0.93e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-206ENST00000460794 568 ntTSL 29.35□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 COG4-210ENST00000564315 729 ntTSL 29.15□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TVP23C-208ENST00000581273 488 ntTSL 39.09□□□□□ -0.953e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-208ENST00000538379 574 ntTSL 49.07□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AHI1-206ENST00000475846 2920 ntTSL 28.84□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PHF21A-218ENST00000532883 1051 ntTSL 58.57□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-218ENST00000532633 597 ntTSL 48.44□□□□□ -1.063e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-213ENST00000527667 530 ntTSL 48.13□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 47.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-218ENST00000545022 544 ntTSL 47.82□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 GABBR1-209ENST00000473774 582 ntTSL 47.03□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.43e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PHF21A-203ENST00000524497 555 ntTSL 54.9□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AHI1-203ENST00000367799 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.11□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.95□□□□□ -1.943e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.161e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.811e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-73■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.483e-73■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-73■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.823e-73■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.38e-7■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 399.6 ms