Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPGDP15428 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPGDP15428 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPGDP15428 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPGDP15428 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HPGDP15428 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HPGDP15428 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HPGDP15428 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HPGDP15428 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HPGDP15428 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HPGDP15428 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HPGDP15428 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HPGDP15428 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HPGDP15428 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms