Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
ARFGEF2Q9Y6D5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARFGEF2Q9Y6D5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARFGEF2Q9Y6D5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARFGEF2Q9Y6D5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARFGEF2Q9Y6D5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ARFGEF2Q9Y6D5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARFGEF2Q9Y6D5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms