Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRELID3BQ9Y3B1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRELID3BQ9Y3B1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRELID3BQ9Y3B1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRELID3BQ9Y3B1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRELID3BQ9Y3B1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRELID3BQ9Y3B1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms