Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCN8AQ9UQD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCN8AQ9UQD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCN8AQ9UQD0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCN8AQ9UQD0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCN8AQ9UQD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCN8AQ9UQD0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCN8AQ9UQD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms