Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
SETD1BQ9UPS6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SETD1BQ9UPS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SETD1BQ9UPS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SETD1BQ9UPS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SETD1BQ9UPS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SETD1BQ9UPS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SETD1BQ9UPS6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SETD1BQ9UPS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.13■■■■□ 3.86
SETD1BQ9UPS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SETD1BQ9UPS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SETD1BQ9UPS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SETD1BQ9UPS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SETD1BQ9UPS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SETD1BQ9UPS6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SETD1BQ9UPS6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SETD1BQ9UPS6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SETD1BQ9UPS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SETD1BQ9UPS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SETD1BQ9UPS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SETD1BQ9UPS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SETD1BQ9UPS6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SETD1BQ9UPS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SETD1BQ9UPS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms