Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN67

PCDHB10, Protocadherin beta-10, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB10Q9UN67 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHB10Q9UN67 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCDHB10Q9UN67 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCDHB10Q9UN67 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCDHB10Q9UN67 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCDHB10Q9UN67 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms