Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN67

PCDHB10, Protocadherin beta-10, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB10Q9UN67 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCDHB10Q9UN67 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHB10Q9UN67 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB10Q9UN67 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB10Q9UN67 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB10Q9UN67 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB10Q9UN67 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB10Q9UN67 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB10Q9UN67 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB10Q9UN67 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB10Q9UN67 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHB10Q9UN67 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHB10Q9UN67 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHB10Q9UN67 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB10Q9UN67 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB10Q9UN67 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB10Q9UN67 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB10Q9UN67 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB10Q9UN67 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB10Q9UN67 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB10Q9UN67 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB10Q9UN67 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB10Q9UN67 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB10Q9UN67 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PCDHB10Q9UN67 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB10Q9UN67 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHB10Q9UN67 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB10Q9UN67 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB10Q9UN67 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB10Q9UN67 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHB10Q9UN67 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHB10Q9UN67 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHB10Q9UN67 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCDHB10Q9UN67 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB10Q9UN67 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB10Q9UN67 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB10Q9UN67 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB10Q9UN67 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB10Q9UN67 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB10Q9UN67 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDHB10Q9UN67 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDHB10Q9UN67 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDHB10Q9UN67 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB10Q9UN67 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDHB10Q9UN67 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDHB10Q9UN67 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDHB10Q9UN67 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDHB10Q9UN67 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCDHB10Q9UN67 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCDHB10Q9UN67 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB10Q9UN67 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCDHB10Q9UN67 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCDHB10Q9UN67 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCDHB10Q9UN67 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCDHB10Q9UN67 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCDHB10Q9UN67 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB10Q9UN67 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB10Q9UN67 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB10Q9UN67 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB10Q9UN67 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHB10Q9UN67 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHB10Q9UN67 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHB10Q9UN67 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB10Q9UN67 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB10Q9UN67 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB10Q9UN67 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB10Q9UN67 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB10Q9UN67 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB10Q9UN67 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB10Q9UN67 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB10Q9UN67 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB10Q9UN67 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB10Q9UN67 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB10Q9UN67 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB10Q9UN67 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB10Q9UN67 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB10Q9UN67 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB10Q9UN67 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB10Q9UN67 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB10Q9UN67 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB10Q9UN67 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB10Q9UN67 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB10Q9UN67 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB10Q9UN67 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB10Q9UN67 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB10Q9UN67 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB10Q9UN67 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB10Q9UN67 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB10Q9UN67 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB10Q9UN67 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB10Q9UN67 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB10Q9UN67 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB10Q9UN67 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB10Q9UN67 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB10Q9UN67 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB10Q9UN67 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB10Q9UN67 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB10Q9UN67 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB10Q9UN67 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB10Q9UN67 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms