Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4AQ9UM21 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT4AQ9UM21 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MGAT4AQ9UM21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4AQ9UM21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4AQ9UM21 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4AQ9UM21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms