Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CTNNA3Q9UI47 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CTNNA3Q9UI47 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CTNNA3Q9UI47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CTNNA3Q9UI47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CTNNA3Q9UI47 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CTNNA3Q9UI47 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CTNNA3Q9UI47 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms